这件事当然可以比较两个单位的强弱，但真正落到每个人头上，主要还是考虑以下四个方面：
第一，评估一下考研的难度，看看自己的水平上哪里更有希望
就跟高考一样，考中科院大气所和南京大学大气科学学院的难度可能是不一样的，你可以通过学长或者直接通过这两个单位的招生部门，了解一下他们历年的分数线、录取率等信息，然后根据自己的水平，评估一下考哪里的把握更大。
第二，看自己喜欢大学的氛围还是研究所的氛围
总的来说，大学的生活是比较丰富多彩的，而研究所则相对枯燥和简单。读研至少有3年时间，如果再继续读博士甚至可以长到5年左右，所以，读研地方的环境和氛围一定要选好。另外，南京和北京的气候也有很大差异，这个也是一个值得考虑的因素，我就认识不少南方的同学和老师，他们无论如何都不愿意在北京待；当然，也认识不少北方的朋友，他们也不愿意在南方待。
第三，调研一下两个单位毕业生的去向，根据自己的职业规划选择更有利的地方
每个单位的毕业生就业去向如何，受欢迎程度如何，这直接关系到自己毕业后的工作问题，所以需要关注。当然，还没进门就考虑出门的事，好像有点太超前了，但这个因素是需要考虑的。
第四，寻找一位中意的导师，导师在哪就选哪儿
大环境怎么样，那都是“别人家”的情况，研究生阶段跟自己接触最多、对自己影响最深的人一般来说都是导师，所以，选择导师可以说是研究生最重要的一件事，这件事的重要性甚至超过了对学校的选择。对我而言，我愿意把导师的选择列为选择读研地点最重要的考虑因素。
最后说一句，我也收研究生哦！
这个问题其实蛮难回答的。之前因为工作的关系，接触了不少南大大气学院的老师，也有几个中科院大气物理所的老师。如果单纯考虑科研的目的，暂时不考虑就业，一直要深造下去，建议还是中科院，毕竟有更多的院士，北京的教育***，以及以后更加广阔的发展前景；如果考虑硕士就结束，不考虑继续深造，南大也是一个很好的选择，南大的地位，大气学院基本排名也在全国院校里面第二，师资力量也够雄厚，并且江浙沪或者周边对大气研究人员的需求比较旺盛，所以南大也是好选择。所以单纯告诉你一个答案并不怎么合适，主要还是看自己的规划，长期点的，中科院要好一些，短期考虑就业的，南大的氛围更好一些。
以下是世界大气海洋及气候专业排名情况：
麻省理工学院（MIT）在大气科学领域具有卓越的声誉和卓越的研究成绩，其“大气、海洋和行星科学”专业被评为全美第一。
斯坦福大学的气候研究、天气预测、大型气候系统模拟以及环境监测等方面均有显著的成就，其“大气与能源研究”专业是世界闻名的科研项目。
普林斯顿大学的“大气与海洋科学研究”专业是全球范围内最好的两个科学领域之一，其学术和研究水平一直受到学术界的广泛认可。
德克萨斯A&M大学的大气科学专业在学术和研究水平上得到了充分的证明，被认为是世界上最好的大气科学研究中心之一。
气象专业好的学校主要分布在美国和北欧的一些国家，如马里兰大学、哥本哈根大学、明尼苏达大学之类的 下面主要是一些美国的学校 1 Cornell University 2 Massachusetts Institute of Technology 3 University of Arizona 4 Columbia University 5 University of Maryland, College Park 6 University of Colorado, Boulder 7 Pennsylvania State University 8 Texas A & M University 9 University of Oklahoma 10 University of Wisconsin, Madison 11 Yale University 12 Princeton University 13 North Carolina State University 14 University of Kansas 15 University of Missouri, Columbia
