南京农业大学在211院校中排名第47位。
“211工程”，即面向21世纪、重点建设100所左右的高等学校和一批重点学科的建设工程，于1995年11月经批准后正式启动。目前我国共有116所211院校。
2023年，南京农业大学最新排名全国第44名（2023年综合排名数据）。
排在南京农业大学前3位的分别是：中国地质大学(北京)（综合排名：41）、暨南大学（综合排名：42）、南京医科大学（综合排名：43）；排在后3位的分别是上海科技大学（综合排名：45）、南京信息工程大学（综合排名：46）、东华大学（综合排名：47）。
